Cartógrafo de origen genovés. Hermano del marino y explorador Cristóbal Colón. Gobernador y Adelantado de La Española. Bartolomé Colón estuvo muy implicado en el proyecto de exploración de su hermano; cuando éste trataba de recabar el apoyo de la reina Isabel a sus planes, Bartolomé viajó a Inglaterra para hacer lo propio con el monarca inglés. Aunque llegó a reunirse con Enrique VIII, el proyecto fue rechazado; a su vuelta y durante su paso por la corte francesa, hizo lo propio con los reyes franceses, sin embargo, estando allí tuvo noticia de la llegada de Cristóbal Colón a América. En 1494 se le encomendó, por parte de los Reyes Católicos, el mando de una flota de tres carabelas de avituallamiento que debían servir a los asentamientos que había dejado el almirante en la zona caribeña. Tras su llegada, se hizo con el gobierno de la Isabela y, más tarde, fue nombrado por su hermano adelantado de la plaza. Este gesto ocasionó importantes tensiones con la Corona. Su labor de gobierno, que combinó con expediciones por la isla, no estuvo exenta de problemas. A él se debe la fundación de la ciudad de Santo Domingo. Los problemas generados a raíz del gobierno de los hermanos Colón impulsó la llegada en 1499 de Francisco de Bobadilla como juez pesquisidor.

Bartolomé Colón acompañó a su hermano en su cuarto viaje de exploración que les llevó hasta las costas centroamericanas. Regresó a la Corte donde trató de ganarse de nuevo la confianza de la Corona; sus últimos años los pasó entre España y sus haciendas de la Española. Murió en Santo Domingo, en el palacio de su sobrino Diego.