Gran Canciller de Bohemia. Perteneciente a una familia noble de la Región de Bohemia-Moravia Perstejn, sus padres fueron el Morava gobernador y conde de Glatz, Juan de Pernestán y su segunda esposa Eduvigis de Schellenberg.

A la edad de trece años, fue llevado por su padre a la corte vienesa del emperador Fernando I y criado junto a los archiduques. Estuvo presente durante la guerra de la Liga de Smalkalda (1546-1547) Después de la muerte de su padre en 1548 Vratislao heredó todos sus bienes. En 1554 acompañó al archiduque y futuro emperador Maximiliano II a la boda del rey español Felipe II con María I de Inglaterra. Cuando Felipe volvió a los Países Bajos, Vratislao fue admitido en la Orden de Toisón de Oro, siendo el primer bohemio en la misma. Un año más tarde se casó con María Manrique de Lara y Mendoza.

Desde 1567 hasta su muerte en 1582 asumió el papel de Coronel Canciller de Bohemia o Gran Canciller de Bohemia; también fue miembro del Consejo Privado.