El condado de Fernán Núñez se crea por Felipe IV en 1639 sobre el señorío de Fernán Núñez. Este señorío de Fernán Núñez se había constituído tras el repartimiento de 1241 tras la toma de Córdoba, por Fernando III de Castilla en la persona de Fernán Núñez de Témez (?-1283). El señorío se mantiene en el linaje de los Gutiérrez de los Ríos hasta el XVI señor de Fernán Núñez, Alonso Estacio Gutierrez de los Ríos, a quien Felipe IV le hace merced del título de conde sobre este señorio por Real cédula de 16 de abril de 1639.

El condado de Fernán Núñez será elevado a ducado por Fernando VII. El VII conde de Fernán Núñez, Carlos Gutiérrez de los Rios (1779-1822) será convertido en I duque, el 23 de agosto de 1817 como premio a los servicios prestados.