Colegio jesuita fundado en Santo Domingo (Virreinato de Nueva España).

Fue heredero del Colegio-Seminario Gorjón fundado en 1540 y convertido en Universidad por Felipe II en 1558, adquiriendo el nombre de Santiago de la Paz y Gorjón. Sin embargo, esta institución logró destacar y con el paso de los años fue decayendo hasta ser escuela de primeras letras y, después, seminario tridentino.

En el año 1701 la Compañía consiguió la autorización para fundar un nuevo colegio en la ciudad, beneficiándose de los bienes dejados por Gorjón, entre ellos, el edificio del anterior Colegio-Seminario. El nuevo colegio fue llamado de San Francisco Javier y recibió varias donaciones, entre las que destacan las de Juan Jerónimo Ribera y Quesada y la de Francisco Sierra Castillo y su esposa Lucía Ferrer, que donaron un ingenio azucarero valorado en 40.000 pesos.

El Colegio tenía clases de educación inferior y de Artes y Filosofía, Teología dogmática y moral. Jurídicamente, al depender de la provincia religiosa del Nuevo Reino de Granada, tomó como modelo las Constituciones y Estatutos de la Universidad jesuita de Santa Fe. Se redactaron estatutos propios que no se llegaron a aprobar debido a la expulsión de los jesuitas en 1767.