Las primeras diligencias encaminadas al establecimiento del Archivo Histórico Provincial de Córdoba tienen lugar en 1944, cuando el entonces alcalde de la ciudad don Antonio Luna Fernández, presenta una moción en ese sentido. La propuesta es acogida favorablemente por el Patronato para el fomento de Archivos, Bibliotecas y Museos de Córdoba que solicita al Ministerio de Educación Nacional la creación del Archivo, lo que tiene lugar por Orden Ministerial de 17 de julio de 1946. El centro inicia una andadura dificil, ya que a mediados de la década siguiente, su directora doña Pilar Sáenz-López, comunicaba que es el notario archivero el que lleva dicho establecimiento sin que la directora oficial intervenga para nada. Así, las primeras transferencias de documentación en el año 1952, las de los protocolos notariales de los distritos de Aguilar de la Frontera, Montoro y Castro del Río, se hacen bajo el control del notario archivero don Vicente Flórez de Quiñones, y quedan en el Archivo de Protocolos de Córdoba sin pasar al Archivo Histórico de forma efectiva hasta el año 1990. A partir de enero de 1958 comienzan a recogerse los libros de Contadurías de Hipotecas, sin embargo hasta tanto el Archivo Histórico tenga edificio, se quedan en el de la Delegación de Hacienda. Como las demandas de espacio son cada día más urgentes, en 1962 se impone adoptar una medida provisional y alquilar un local en la calle Luis Ponce de León para depositar los fondos; pero no es hasta dos años después cuando se produce el primer traslado de documentos, toda la documentación de Hacienda de más de veinticinco años, a lo que se añade el fondo de Jefatura Agronómica y los de Contadurías de Hipotecas. Además se realizará también la transferencia de los protocolos centenarios de los distritos de Cabra y Baena. Mientras tanto se sigue buscando un edificio para sede definitiva del Archivo, optando por la iglesia de Santo Domingo de Silos. Las obras de adaptación del edificio se inician en noviembre de 1980, realizándose el traslado a su nuevo y definitivo emplazamiento en 1984. Posteriormente sus fondos se han visto aumentados con varios depósitos y transferencias, Protocolos Notariales de Córdoba y de varios distritos de la provincia, documentación de organismos extinguidos (Sindicatos, Sección Femenina, etc..), documentación de la Audiencia Provincial, documentación autonómica de las distintas Delegaciones Provinciales de las Consejerías, etc.