Jefe de la Sección de Taxidermia del Museo Nacional de Ciencias Naturales. Hijo del también taxidermista José María Benedito Mendoza que estableció su taller en la calle Corregería de Valencia. José María trabajó como contable y, en sus horas libres, ayudaba a su padre en el taller. Tras el fallecimiento de su progenitor se puso al frente del taller y en 1905 se convirtió en Proveedor Real y Naturalista- Disecador de Alfonso XIII. Dos años más tarde obtenía plaza como taxidermista en el Museo de Ciencias Naturales y, tras el traslado de la familia a Madrid abrió un taller que estuvo ubicado en la calle Ramón de la Cruz. Su hermano Luis acudió al mismo para poder hacer frente al trabajo.

En 1929 se casó con Pilar Velázquez- Duro, hija de la marquesa de Felguera, lo que le permitió dejar el trabajo en el taller, que asumió Luis, y dedicarse a su actividad en el Museo, así como al coleccionismo. La gran especialidad de José María fueron las aves y ocupó el cargo de jefe del laboratorio de Taxidermia del Museo de Ciencias Naturales hasta su jubilación en 1943. Fue, junto a su hermano, un gran impulsor de los dioramas, lo que les obligó a hacer concienzudas observaciones de los animales al natural.