Natural de Salamanca. Hijo de Juan Vázquez de Coronado y de Isabel de Luján. Casado con Beatriz de Estrada, hija del tesrero Alonso de Estrada.

En 1535 fue nombrado visitador de las minas de plata y en el cargo de gobernador de la Audiencia de la Nueva Galicia en sustitución del primer gobernador y capitán general de la provincia Nuño de Guzmán. Como tal apoyó a fray Marcos de Niza a explorar el norte de México en la misión que le había conferido el virrey Antonio de Mendoza. Salió de Compostela en 1540, llegó a Cibola y comprobó la falsedad de los relatos de fray Marcos de Niza. Conociendo que había otras tierras habitadas en la zona, delegó su exploración en Pedro de Tovar, quien descubrió otras siete ciudades, más populosas que Cibola. Poco después, otros miembros de la expedición descubrían el Gran Cañon y la boca del río Colorado, el golfo de California y la región de Tiguex, a orillas del Río Grande del Norte.

En esta última se instaló Vázquez durante los inviernos de 1540 y 1541, aún convencido de que podía hallar Quivira. Con este propósito abandonó Tiguex en 1541 y recorrió las llanuras entre el Mississippi y las montañas Rocosas hasta llegar a la actual Kansas. En la primavera de 1542 regresó a México, donde el virrey Mendoza lo acogió con frialdad y le abrió proceso por su abandono de la empresa encomendada.

De su matrimonio con Beatriz Estrada, hija de Alonso de Estrada y Marina Gutiérrez Flores de la Caballería, nacieron varios hijos:

1. Juan Vázquez Coronado, fallecido prematuramente

2. Isabel de Luján, que contrajo matrimonio con Bernardino Pacheco Bocanegra

3. Mariana Vázquez de Coronado, que casó con Nuño Chavez Pacheco Bocanegra

4. Luisa de Estrada, que casó en dos ocasiones: con Luis Ponce de León y con Martín de Irigoyen

5. Jerónima Vázquez de Coronado