En el año 1532 el párroco de Monforte, Mosén Pedro Seva, realiza una visita a Orito y allí decide que se ha de fundar una ermita en el manantial de Orito conocido como Fuente Santa. La ermita se llamaría Natividad de Nuestra Señora, y su construcción se realizaría entre los años 1542 y 1552 con las donaciones de los condes de la Granja.

Según la tradición, en el año 1555 fray Jorge Martínez, de la orden de la Merced, encuentra una imagen de la virgen de tan sólo 42 milímetros. A partir de este momento la imagen comenzó a recibir múltiples visitas de peregrinos, por lo que el Consell de Monfort decide construir un convento. En un principio el Consell quiso dar el convento a los Observantes de Alicante, pero éstos lo rechazan en 1557. Más tarde fue la orden de la Merced la que intentó obtener el convento, pero esta vez fueron rechazados por el Consell. Finalmente serían los alcantarinos los que obtendrían la custodia del convento. Las obras, que habían sido iniciadas el 16 de agosto de 1559, finalizan en 1562, fecha en la que los descalzos toman posesión del convento, siendo el primer custodio fray Alonso de Llerena.

La construcción de la iglesia se realizó en el año 1600 sobre el solar de la antigua ermita que por aquel entonces amenazaba ruina. En 1607 se produjeron unas obras de renovación profunda de la iglesia. La nueva iglesia fue inaugurada mediante misa por fray Andrés de Balaguer, obispo de Orihuela. Sería en este convento donde tomaría los hábitos San Pascual Baylón en 1565.

En 1835 el convento ha de cerrar definitivamente sus puertas como resultado de la exclaustración decretada por Mendizábal.