El día 1 de septiembre de 1588, el maestro Doctor Francisco Sánchez, catedrático en propiedad en la Universidad de Salamanca y canónigo magistral, firmaba ante el escribano Cristóbal Rodríguez el documento definitivo de la fundación de este Monasterio. Se funda en las casas que el doctor Francisco Sánchez tenía al lado de la Plaza Mayor, frente a la Iglesia Parroquial de Santiago Apóstol, en la calle de la Trinidad.

Las primeras monjas procedían de la comunidad de Villoruela (Salamanca) para enseñar la Regla y el espíritu de la Orden a las jóvenes de la familia del fundador y a las de otras familias que deseaban formar parte de la comunidad. Llegaron siete monjas, y el primer nombre que recibió el monasterio fue el de Nuestra Señora de los Ángeles, recordando así el primer monasterio trinitario en Avingaña (Lérida). A los pocos años de la fundación la comunidad alcanza el número de noventa hermanas. En 1622 profesa Sor Constanza de Rojas, sobrina del ilustre santo trinitario Simón de Rojas, el cual visita en diversas ocasiones a la comunidad. Sor Constanza será priora del Convento en distintos momentos de su vida.