El rey Felipe II, en la ciudad de Guadalajara el 29 de agosto de 1563, dictó una Real Cédula por el cual creó la Real Audiencia de Quito con territorios desgajados de la Lima. Fue inaugurada el 18 de septiembre de 1564. Dicha fundación obedece al plan de la Corona para reorganizar el territorio del Perú tras los primeros momentos de conquista, siendo su fundación coetánea a la de las Audiencias de Charcas y Chile (suprimida poco después).
La Audiencia y Chancillería Real de Quito (1563-1822) fue el máximo Tribunal de justicia de la Corona española con jurisdicción sobre los territorios de la Provincia o Presidencia de Quito, estando esta presidencia o gobernación subordinada primero al Virreinato del Perú y, posteriormente, al Virreinato de Nueva Granada, mientras que la jurisdicción de la Audiencia fue autónoma.
La Recopilación de Leyes de Indias de 1680, en Ley X (Audiencia y Chancilleria Real de San Francisco del Quito) del Título XV (De las Audiencias y Chancillerias Reales de las Indias) del Libro II, se hace eco de la Real Cédula de fundación, de 1563, y recoge los límites y los oficiales de esta Audiencia.
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