Parte del edificio ha sido cedido y es utilizado por la Universidad de Alcalá de Henares como sede para diferentes organismos de la institución (la Asociación de Antiguos Alumnos o la Asociación de Amigos de la Universidad)
El convento fue fundado en el año de 1574 gracias a las donaciones hechas por un canónigo de la Iglesia Magistral, Gutiérrez de Cetina. Entregaría a la orden franciscana unas casas de su propiedad, incluida su vivienda, además de una dote para sustentar a la nueva comunidad.
Mandó construir junto al nuevo convento una iglesia siguiendo el modelo de la Capilla de San Ildefonso de Alcalá de Henares.
El convento sufriría, años después, las medidas de exclaustración de Mendizabal que les harían perder sus bienes pero lograron mantenerse en el convento.
Han conseguido llegar hasta la actualidad gracias a la cesión de parte del edificio a la Universidad de Alcalá y a su trabajo de reposteria.
Página Web Institucional