Alcance y Contenido:

En esta sección se conserva el Archivo de la Capitanía general de la isla de Cuba. El Capitán General era la suprema autoridad civil y militar y su importancia fué muy grande en el siglo XVIII, aumentando aún más al producirse en 1795 la entrega de Santo Domingo a Francia y trasladarse la Audiencia a Puerto Príncipe.
Al irse desmembrando el imperio, ya en el siglo XIX, la Habana va a convertirse en la capital española del Caribe, lo que explica que se conserven archivos de territorios fuera de la isla.
La relación con los territorios de Luisiana y Florida fué continua. Cuando la Luisiana fué entregada a Francia se llevaron sus archivos a Panzacola. De allí se trasladan a La Habana en vísperas de la cesión de las Floridas a E.E.U.U.
De la documentación de Florida Oriental solo pasó a la Habana la correspondiente a Tesorería, el resto permaneció allí. En 1883 se tomó la decisión de enviar al Archivo General de Indias los fondos de Cuba, pero el proyecto no siguió adelante.
Una segunda orden de 8-1-1884 volvió a ordenar el traslado que no emplezó a efectuarse hasta 1888; en este año, el archivero Nemesio Cornejo de Villarroel, que estaban en La Habana, fue comisionado para preparar los documentos para su envío. Entre 25-VI-1888 y 25-VI-1889, se enviaron 13 remesas, todas ellas acompañadas de inventarios de entrega confeccionados por el Sr. Cornejo, tomando los títulos de los inventarios existentes en Cuba o copiando las cartelas de los legajos.
Al llegar las remesas se colocaron en el Archivo por el orden de llegada y los inventarios también.
Las series documentales existentes en la Sección son las siguientes:

I.- FLORIDA OCCIDENTAL (1729-1824)

Son documentos que están mezclados con los de Luisiana. Contiene los siguientes grupos de documentos:

- Correspondencia de gobernadores de Luisiana con los capitanes generales de Cuba, ministros de Indias, virreyes de Nueva España, obispos de Luisiana y cónsules de España en Estados Unidos.
- Correspondencia de los comandantes de Panzacola.
- Correspondencia de los intendentes de Luisiana y Florida.
- Correspondencia de los comandantes de Mobila.
- Expedientes sobre asuntos civiles, criminales y militares.
- Reales Cédulas y despachos.
- Cuentas de Tesorería y Real Almacén de Panzacola.
- Oficios para la conclusión de asuntos de Luisiana, tesorería del
puesto de Nogales y hospital de Panzacola.
- Ajustes militares, listas de revista de tropas de Panzacola y
Apalache.
- Expedientes de tesorería de Nueva Orleáns y Panzacola.
2.- FLORIDA ORIENTAL (s. XVIII-XIX). Comprende:

- Cuentas de tesorería, almacén real y hospital de San Agustín.
- Listas de revista, ajustes, etc. de las compañías de San
Agustín.
- Correspondencia de los contadores de San Agustín.
- Cuentas de oficiales de San Vicente Ferrer, San Juan e isla
Amalia.
- Registros de entrada y salida de San Agustín.
- Asientos de empleados.
- Documentos de floridanos (colonos españoles de Florida
trasladados a Cuba cuando la cesión a Inglaterra en 1763).
- Expedientes de tesorería de San Agustín, Nueva Orleáns y
Panzacola.
3.- LUISIANA (S.XVIII-XIX). Comprende:

- Cuentas de tesorería, aduana, contaduría y almacén de Nueva
Orlenas.
- Correspondencia de los intendentes de Luisiana y Florida
Occidental con los ministros de Hacienda, Gobernador de
Luisiana, contadores de Nueva Orleáns y Panzacola, intendente de
La Habana, Tribunal de Cuentas de La Habana, comandantes de
Panzacola y Mobila, oficiales de la tesorería de Panzacola,
oficiales de la aduana de Nueva Orleans y comandantes y
guarda-almacenes de los puestos de Luisiana.
- Cuentas de guardalmacenes de Natchez, Nogales, Placaminas,
Mobila y Nuevo Madrid.
- Documentos del hospital de Nueva Orleáns.
- Reales Ordenes y Cédulas.
- Asientos, listas de revista y ajustes de tropas y empleados.
- Hojas de servicio de oficiales de Luisiana.
- Documentos relativos a la ciudad de Nueva Orleans.
- Correspondencia de contadores de Luisiana.
4.- CARTAGENA DE INDI
AS (1774-1821)

- Correspondencia con el Gobernador.
5.- NUEVO REINO DE GRANADA (1813-21)

- Correspondencia con el Virrey y el subinspector.
6.- COSTA FIRME (1814-25)

- Correspondencia recíproca con autoridades.
- Cuentas, ajustes y revistas militares.
7.- SANTA FE

- Correspondencia con las autoridades y papeles judiciales.
8.- VERACRUZ (1791-1838)

- Correspondencia con autoridades y papeles judiciales.
9.- PUERTO CABELLO (1776-1838)

- Correspondencia con el gobernador Sr. Moscoso.
- Cuentas de tesorería.
10.- CASTILLO DEL MORRO DE LA HABANA

- Correspondencia de los comandantes.
- Cuentas.
11.- SANTO DOMINGO (1860-66)

- Correspondencia con el Gobernador.
- Cuentas.
12.- SANTIAGO DE CUBA

- Papeles judiciales militares de Cuba. (Sumarias).
13.- CAPITANIA GENERAL DE LA HABANA (1766-1845)

- Correspondencia y documentaión de los gobernadores desde
Bucareli a Ezpeleta.
14.- VARIOS

- Documentos de México (1845-47)

- Deuda de España a Estados Unidos (1824-44).
- Documentos de Honduras, Chile y Perú.
La documentación de esta Sección es el complemento de la que sobre la isla de Cuba y territorios a que se refiere, se conserva en las Audiencias y en Ultramar