Alcance y Contenido:

1536
Minuta de la provisión del Emperador prohibiendo el comercio con la Berbería desde el estrecho de Gibraltar hasta la costa de Valencia (1).

1539
Cartas del Emperador (24); Mohamed el Hazem (original en árabe y traducción) (3,4), rey de Túnez (1); Pedro de Oña (48-51,100,101,105); don Enrique Enríquez, capitán de galeras (52-54); don Rodrigo Manrique (55,102); Francisco Verdugo y Diego de Cazalla (56-60,98,99); don Miguel de Herrera, capitán de artillería (62-73,81-83,89-97); don Bernardino de Mendoza (84,85,103); Miguel de Perea, capitán (86,87); ciudad de Gibraltar (88); Diego de Lira (104); Gaspar de Solórzano (106) y Ferramolino (46) sobre :
El rey de Vélez desposeído por el Jerife ofrece al Emperador los reinos de Fez, Marruecos y Cuz (2).
Mohamed el Hazem, rey de Túnez, pide socorros para librarse de los turcos (4); capitulaciones con Muley Hazem (5), rey de Túnez, y las que don Francisco de Tovar piensa hacer con Hamida, el nuevo rey de Túnez (6).
Lugares de moriscos que están organizados para sublevarse (7).
Provisiones de galeras (48,49,52,54,56,100,101,105), artillería (64,66,69,70,80-92,94), fortalezas de Cartagena (55,70,73,79), Almería (55), Ibiza (85,104), Bona (58,53,73,74,76,77,80), La Goleta (58,60,73,75,77,78), Gibraltar (55,70,79,86,95) y Cádiz (70,79,93).
Sueldos de oficiales españoles y de algunos flamencos (71,100).
Motín de los oficiales de artillería contra Luis Ortiz (89).
Relato minucioso de la guerra de Lombardía desde el año 1521 hasta 1529 (106).
Asiento tomado con Álvaro de Benavente y Rodrigo de Dueñas sobre el dinero y mercancías que han de proveer para La Goleta y Bona (13).
Inventos que Blanco de Garay propone al Emperador para la armada (22).
Alarde de las galeras de don Álvaro de Bazán (18).
Cédula Real ordenando al conde de Alcaudete que pague a San Juan de Guereña, solicitador de Orán, las cantidades que se abonan a su antecesor en el cargo, acompaña el título (24).
Dotes que paga la Emperatriz a huérfanas (25,26).
Testimonios de las cartas de perdón de Diego de Hoyos por la muerte de su esposa María García (27-30).
Nombramiento de interprete de Orán a favor del judío Isaac Ternero (31-34).
Autorización de uso de armas al recién convertido Francisco Raquea, mercader de Granada (35,36).
Acusaciones contra Nicolás Garri, vicario de Cartagena (45).
Memoriales de la artillería venida de Flandes y su coste (8); artillería distribuida en diversas fortalezas españolas (9-11); abastecimiento de La Goleta y Bona (12,13); artillería del duque del Infantado (14); gasto de la artillería y el orden que se debe tener en ella (15,16); peticiones de don Berenguer de Requesens, capitán de las galeras de Sicilia (17); Juan Martínez de Olózaga, contador, pide retribución de sus largos servicios (18); acompaña los poderes concedidos por el Rey (19-21); diversas peticiones de : Antonio de Antequera, escudero de la capitanía del comendador Diego de Narváez (37,38); Francisco Verdugo (39,40); don Álvaro de Bazán (61); y de los capitanes Pedro Gaitán (41,42); Varáez (43); y Juan Pérez de Araguntía (44).

1551
Cuentas de diversos gastos de Italia (107).