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Índices de cartas numeradas del 1 al 84 de Rafael María de Aguilar, gobernador de Filipinas, al secretario de Estado y del Despacho de Gracia y Justicia de España e Indias de los años 1793 a 1803:

- Índice de cartas nº 1 a 13 de Rafael María de Aguilar, gobernador de Filipinas, a Pedro de Acuña, secretario de Estado y del Despacho de Gracia y Justicia de España e Indias. Con anotaciones al margen del tramite seguido. Manila, 3 de diciembre de 1793.
- Minuta de acuse de recibo de estas cartas y de las de su antecesor nº 1 a 20, 21 a 23 y 26 a 29. El Escorial, 19 de noviembre de 1794

- Índice de cartas nº 14 a 18 de Rafael María de Aguilar, gobernador de Filipinas, a Pedro de Acuña, secretario de Estado y del Despacho de Gracia y Justicia de España e Indias. Con anotaciones al margen del tramite seguido. Manila, 23 de julio de 1794.
- Minuta de acuse de recibo de estas cartas. Aranjuez, 30 de abril de 1795.

- Índice de cartas nº 19 a 21 de Rafael María de Aguilar, gobernador de Filipinas, a Eugenio Llaguno Amírola, secretario de Estado y del Despacho de Gracia y Justicia de España e Indias. Con anotaciones al margen del tramite seguido. Manila, 5 de agosto de 1795.
- Minuta de acuse de recibo de estas cartas. El Escorial, 27 de septiembre de 1796.

- Índice de cartas nº 23 a 40 de Rafael María de Aguilar, gobernador de Filipinas, a Eugenio Llaguno Amírola, secretario de Estado y del Despacho de Gracia y Justicia de España e Indias. Con anotaciones al margen del tramite seguido. Manila, 5 de julio de 1796.
- Minuta de acuse de recibo de estas cartas. Aranjuez, 6 de mayo de 1797.

- Índice de carta nº 41 de Rafael María de Aguilar, gobernador de Filipinas, a Eugenio Llaguno Amírola, secretario de Estado y del Despacho de Gracia y Justicia de España e Indias. Manila, 31 de enero de 1797.
- Idem nº 42 y 43. Manila, 2 de marzo de 1797. Con duplicado.
- Minuta de acuse de recibo de estas cartas. El Escorial, 30 de noviembre de 1798.

- Índice de cartas nº 66 y 67 de Rafael María de Aguilar, gobernador de Filipinas, a José Antonio Caballero, secretario de Estado y del Despacho de Gracia y Justicia de España e Indias. Con anotaciones marginales. Manila, 14 de agosto de 1799.
- Ídem n º 68 y 69. Manila, 28 de febrero de 1800. Con anotaciones marginales.
- Ídem n º70 a 73. Manila, 14 de julio de 1800. Con anotaciones marginales.
- Minuta de acuse de recibo de estas cartas. Aranjuez, 22 de abril de 1801.

- Índice de cartas nº 75 a 77 de Rafael María de Aguilar, gobernador de Filipinas, a José Antonio Caballero, secretario de Estado y del Despacho de Gracia y Justicia de España e Indias. Manila, 15 de julio de 1802.
- Ídem n º78 y 79. Manila, 31 de diciembre de 1802.
- Minuta de acuse de recibo de estas cartas. Aranjuez, 19 de junio de 1803.

- Índice de cartas nº 80 a 84 de Rafael María de Aguilar, gobernador de Filipinas, a José Antonio Caballero, secretario de Estado y del Despacho de Gracia y Justicia de España e Indias. Manila, 6 de abril de 1803.
- Minuta de acuse de recibo de estas cartas. El Pardo, 12 de febrero de 1804.