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Los Libros de Conocimiento son fundamentales para conocer el funcionamiento de la Secretaría. En ellos se asienta un resumen de todo expediente que en algún momento debía salir de la Secretaría para seguir el trámite administrativo. Son, por tanto, libros de préstamo de documentación, indicándose al margen la fecha de devolución del expediente, y rayando el asiento como señal de cancelación del préstamo. Este es un sistema de control administrativo que el Consejo de Castilla había iniciado en 1712, y que proporciona abundante información sobre los expedientes que se tramitaban en la Secretaría, algunos de ellos hoy perdidos. Hay 10 Libros de Conocimiento de los expedientes que pasan al Relator', años 1744-1833, y 4 Libros de Conocimiento de los expedientes que pasan al Fiscal, años 1742-1833, es decir, pocos años después de la creación de la plaza de fiscal. Los Libros de Conocimiento de los expedientes que pasan al Consejo de Castilla, son 18 de los años 1596 a 1836. Esta serie, que parece estar íntegra en el A.H.N., es el reflejo documental de las relaciones entre el Consejo de Castilla y la Cámara de Castilla, causantes de continuas remisiones de asuntos de un Consejo a otro. En el Consejo de Castilla se llegó a establecer, por ello, un recurso de retención de gracias otorgadas por la Cámara, motivado por el daño que éstas pudieran provocar en legítimos intereses de terceros. El mismo procedimiento se siguió cuando se refundieron las Secretarías de Gracia y Justicia, en 1717. Incluso en el último libro de la serie (CONSEJOS,L.2.888) se refleja el préstamo de expedientes de la Sección de Gracia y Justicia del Consejo Real de España e Indias a la Escribanía de cámara del Tribunal Supremo de España e Indias, organismos que asumen las funciones que antes pertenecieron a la Cámara de Castilla y al Consejo de Castilla.