Sobre la historia de este convento hay dos versiones diferentes, que aquí os plasmo.

El diccionario de Historia Eclesiástica de Quintín Aldea Vaquero, Tomás Marín Martinez y José Vives Gatell, fija la fecha de fundación sobre 1526 y dice de él:

"Dio origen a este último una ermita fundada en 1495, mediante bula de Alejandro VI, por Isabel de Aguilar, esposa de Don Lorenzo Suarez de Figueroa, embajador en Roma. Una vez viuda, se recogió y sepultó en él, y su sobrina, Elvira de Aguilar, nombrada priora perpetua, lo trasformó en monasterio de monjas jerónimas hacia 1530."

María Isabel Viforcos Marinas, María Dolores Campos Sánchez-Bordona afirman en su libro "Fundadores, fundaciones y espacios de vida conventual: III Congreso Internacional Monacato Femenino en España y Portugal" que fue beaterio desde 1517 y convento de clausura en 1539*. Coinciden con la bula papal, fechándola en el 26 de septiembre de 1495, pero otorgando permiso únicamente para levantar la ermita.

Estas mismas fuentes afirman que junto con el monasterio de la Magadalena de Jaraiz de la Vera, se unió al de Santa María de la Concepción de Trujillo.

Según Madoz, en su Diccionario geográfico-estadístico-historico de España y sus posesiones de ultramar, es suprimido y tras su posterior venta desaparece. Dato en el que coincide con William S. Kurt, en su libro "Retrato de una ciudad: Badajoz en el siglo XVI según los libros de hacienda de la Cofradía y Hospital de la Concepción", el cual lo nombra también como convento de Santo Nuflo.

Sebastián Román Téllez, en su trabajo "La ciudad de Badajoz: Demografía y sociedad en el siglo XVIII" entendemos que se suma esta corriente al constatar que el monasterio existía en 1759 y 1787. .

Siguiendo esta tendencia, Fernando de la Iglesia Ruiz afirma que se exclaustró en 1835, habilitándose posteriormente para acoger el Gobierno Civil y la Escuela Normal de Maestras, lo que será la Caja de Badajoz hasta su traslado a San Francisco, sobre una parte del antiguo cuartel y convento de San Francisco. Actualmente no quedan restos por estar ocupado por la avenida Juan Carlos I.

*En 1538 dice José Sarmiento Pérez en "El Plan Beneficial del Obispo D. Manuel Pérez Minayo sobre la Diócesis de Badajoz en 1770."