Nació en África, pero fue esclavizado y llevado cautivo a la provincia norte de Saint-Domingue donde trabajó en la plantación de Papillon en las últimas décadas del siglo XVIII.

El primer líder de los esclavos sublevados en la revolución haitiana en la zona norte de la isla. En 1791, Juan Francisco y Georges Biassou, llamado solo Jorge por los españoles, lideran el alzamiento de los esclavos contra España, Inglaterra y Francia. Tanto Francia como España trataron de atraerse el apoyo de Juan Francisco con el fin de utilizarlos contra la otra parte y, al finalizar la guerra Francia pidió a la corona española que evacuase a sus colaboradores, por lo que el gobernador los dividió en dos grupos y los envió a distintos lugares: Jorge Biassou, acompañado de una veintena de personas a Florida y Juan Francisco fue enviado a Cádiz, con más de un centenar de personas, donde llega en 1796.

En Cádiz, donde pasó con su familia, su situación económica fue precaria y solicitó, en 1798, al rey que le concediese el grado de Teniente general dado que alegaba que le fue concedido por el Comandante General Gabriel de Aristizábal. De su vida en España se conocen, fundamentalmente, sus quejas por la situación de precariedad económica en la que vivía y por no reconocerle sus méritos militares.

A su muerte, a su mujer, María de la Asunción de Milo, se le concedió una pensión de cuatro reales en 1806.