El convento de la Concepción de Mondragón en Guipúzcoa, tiene su origen en un beaterio. Este se localizaba en un arrabal de villa, denominado «Maala», extramuros de la ciudad, en unas tierras de labor que compran María Bañez y Juan Ochoa de Olariaga.

En 1511, la villa otorgó un favor para fundar la Casa de las Beatas de N. P. San Francisco. En 1613, según fuentes, están acogidas a la Tercera Orden de Sta. Isabel. Y ya en 1923, por Rescripto de la Santa Sede, se autoriza a las monjas para adoptar la Regla de la Orden de la Inmaculada Concepción.

A lo largo de la historia, el Monasterio ha sufrido diversos avatares. Sufrió la Guerra de Convención (1793-1795), siendo utilizado como cuartel y en 1808, fue ocupado para alojamiento de los soldados de la tropas aliadas de Francia, durante la Guerra de Independencia (1808-1814). En la Guerra Civil, 1936, fue destrozada totalmente la iglesia y parte del Monasterio.

Así a lo largo de su historia lleva a cabo distintas reedificaciones.

Y finalmente por razones urbanísticas, en febrero de 1978, la Comunidad se traslada al nuevo Monasterio, sencillo, funcional, donde ahora viven las hermanas.

El edificio original, de este convento desde 1959, atendiendo a las necesidades del pueblo, acogió un parvulario, que años mas tarde, al cambiar de emplazamiento cerró.

El actual convento de la Concepción de Mondragón, se localiza. desde 1978 en las faldas del monte Udalaitz, en la carretera de Udala.

En 1986, la Comunidad recibe a 11 hermanas de la Comunidad de Villasana de Mena, Burgos, tras la supresión canónica de este Monasterio.