Unidades Relacionadas por Procedencia:
En este Archivo en el Fondo Ocio-Salazar se conserva un Libro con el estudio genealógico de Juan Ruiz de Vergara Dávila de 1640, el VI señor de Viloria (Sig.OCI,20893)
Otras Unidades Relacionadas:
En el Archivo de la Chancillería de Valladolid está el pleito de hidalguía ganado en 1551 por su padre, Juan Ruiz de Vergara (Sig. SALA DE HIJOSDALGO,CAJA 72,5).
En el Archivo Histórico Nacional en el Fondo de la Orden de San Juan se conserva el Expediente de pruebas para la concesión del título de caballero de esta Orden a Juan Ruiz de Vergara en 1553 (Sig. OM_SAN_JUAN_DE_JERUSALÉN, EXP.23177).
En el Archivo General de Simancas en el Fondo de la Contaduría mayor de Hacienda se conservan diversos juros concedidos a Juan Ruiz de Vergara (Sign. CME, 693, 16 y 14; CME, 337, 41; CME, 324, 26; CME, 62,44,2; CME, 348,17; CME, 376,41) y a Ruy Díaz de Vergara (Sig. CME,785, 2 y 4).
En la Sección Nobleza del Archivo Histórico Nacional en el Archivo de los duques de Baena se conserva el Memorial sobre el pleito por la posesión de los mayorazgos fundados por Juan Ruiz de Vergara y su mujer entre Diego de Vergara y Vela, marqués de Navamorcuende y Tomasa Hurtado de Mendoza, condesa de Santa Cruz de los Manueles y Francisco Javier Cruzat y Góngora, marqués de Góngora en 1752 (Sig. BAENA, C.196).
En el Archivo General de Indias en la Sección de la Casa de Contratación se conserva un privilegio de juro sobre la Contratación de Sevilla (nº 3) otorgado a favor de Juan Ruiz de Vergara en Vitoria en 1562 (Sig. CONTRATACIÖN, 1063 nº 4); enla Sección de Indiferente General se conserva una Real Cédula de 1599 concediendo licencia a Juan Ruiz de Vergara de dos esclavos negros (Sig. INDIFERENTE,425,L.23,F.418V); en la Sección del Catálogo de Indias la contratación de Juan Ruiz de Vergara para ir al Perú como criado de Diego López de Zúñiga y Velasco, conde de Nieva y virrey del Perú (Sig. PASAJEROS,L.4,E.550)