Secretario real. Natural de Éibar (Guipúzcoa). Hijo de Cristóbal Pérez de Herrera y Magdalena de Mallea. Casado con Catalina de Rojas y Aguilera

Se incorporó como oficial en la Secretaría de Obras y Bosques, cuyo titular era Pedro del Hoyo. Cuando éste falleció en 1568 fue nombrado en su lugar el secretario Martín de Gaztelu permaneciendo bajo su mando en los asuntos de palacios, casas, jardines, cotos y demás bienes del patrimonio real. Las relaciones entre el secretario y el oficial no fueron amistosas, quizás porque Ibarra también trabajaba en el escritorio de Antonio Pérez. Cuando, en 1579, el famoso secretario aragonés cayó en desgracia y fue apresado, igualmente Ibarra fue enviado durante un mes a la cárcel. La situación fue transitoria y pronto fue rehabilitado.

En 1580, a la muerte de Gaztelu Felipe II le nombró secretario interino de Obras y Bosques, encargándose al mismo tiempo de los papeles de Italia en la Secretaría del cardenal Granvela. Tras demostrar su valía en estos cometidos, en 1585 Felipe II le despachó título de secretario real, con destino en el Consejo de Indias.

Su influencia fue creciendo. Ibarra intervino en la Junta de Armadas, en la Junta de Guerra de Indias, y en diversas juntas mixtas de Indias y Hacienda. Cuando en 1601, finalmente, se creó la Cámara de Indias, encargada de proponer los nombramientos y mercedes, se le incluyó como secretario con voto consultivo. En 1604 fue nombrado consejero de Indias y de la Cámara