Fernando Álvarez de Toledo nació hacia 1527 en La Aldehuela (Ávila).

Fue militar, caballero y gran prior de la Orden de San Juan de Jerusalén (también conocida comoOrden de Malta), virrey de Cataluña y miembro del Consejo de Estado.

Su juventud quedó reflejada porLope de Vegaen su comedia "Más mal hay en la Aldegüela de lo que suena", también conocida como "El Prior de Castilla".

Fue hijo ilegítimo deFernando Álvarez de Toledo y Pimentel, que lo tuvo cuando estaba soltero y aún no había sucedido en laCasa como IIIduque de Alba y de una molinera deLa Aldehuela (Ávila).

Legitimado por su padre, fue nombradocaballerode laOrden de San Juan en 1541. Tras su estancia en Italia luchando contra los franceses, en 1558 es nombrado por Felipe II gran prior de Castilla en la Orden de San Juan, puesto relevante con importantes rentas.

En 1566 recibe el título de capitán general de las tropas que Felipe II envía a La Goleta (Túnez), para combatir el peligro turco.

En 1567 es nombrado general de la caballería de Flandes, cargo del que será relevado en 1570 cuando se le encomienda acompañar desde Flandes a España a Ana de Austria, quien contraerá matrimonio con Felipe II.

Entre 1571 y 1579 ocupó el cargo de virrey de Cataluña.

En 1580 acompaña a su padre en la guerra contra Portugal que permitió a Felipe II ser nombrado rey de de este país.

Tras fallecer su padre en 1582, es autorizado para residir en la corte, donde permaneció hasta su muerte. Se ocupa de asuntos relativos a su familia, ya que su hermano Fadrique, IV duque de Alba, había muerto sin sucesión y el heredero de la Casa, Antonio de Toledo y Beaumont, solo tenía quince años.

En 1587 es nombrado por Felipe II consejero de Estado, cargó que desempeñó hasta su fallecimiento en 1591.

Fue enterrado en Consuegra (Toledo), cabeza del Priorato de la Orden de San Juan de Jerusalén.