La Comisaría General de Fronteras y Puertos se crea por Decreto del Ministerio de la Gobernación de 3 de junio de 1937. El personal de esta Comisaría es el del Cuerpo de Investigación y Vigilancia, siendo designado por la Dirección General de Seguridad a propuesta del comisario general.

Sus funciones son la investigación y vigilancia de las zonas fronterizas, la revisión de pasaportes y la estadística del movimiento de viajeros y embarcaciones. Su residencia estará donde resida el Gobierno de la República y su jurisdicción se divide en tres zonas: Cataluña y la zona de Huesca; Castellón de la Plana y Valencia, y Alicante, Murcia, Almería y la parte leal de Granada.

Tiene que rendir cuenta de todos sus informes y servicios ante la Dirección General de Seguridad y la de Carabineros El 25 de agosto de 1937 la Gaceta de la República publicaba una orden que disponía que todo el personal a las órdenes de la Comisaría General de Fronteras y Puertos en Cataluña, pasase a depender del delegado general de Orden Público, en representación del Gobierno, en la región autónoma.