Sus padres fueron Francisco de Zúñiga, IV marqués de Ayamonte, y Ana Felisa de Zúñiga, hija de Francisco de Zúñiga Sotomayor, IV duque de Béjar, y de su segunda esposa Brianda Sarmiento de la Cerda. Casada en dos ocasiones: la primera, con Rodrigo de Guzmán, I conde de Saltes (fallece en 1641), hijo de Alonso Pérez de Guzmán el Bueno, VII duque de Medina Sidonia, X conde de Niebla, IV marqués de Cazaza, señor de Sanlúcar de Barrameda, señor de Gibraleón, y de Ana de Silva, hija de Ruy Gómez de Silva, I príncipe de Éboli, I duque de Estremera, I duque de Pastrana, y de Ana de Mendoza de la Cerda, II princesa de Melito. Hijos: Antonio, II conde de Saltés, que murió sin sucesión. Su segundo matrimonio fue en 1616 con Íñigo López de Mendoza (fallece en 1656), VI marqués de Mondéjar, VIII conde de Tendilla, señor de Almoguera, hijo de Íñigo de Mendoza, V marqués de Mondéjar, VII conde de Tendilla, señor de Almoguera, y de Ana de Cabrera Vargas, hija de Diego de Vargas. Hijos: 1º María, futura VII marquesa de Mondéjar.