La orden agustina se asienta en Valencia tras su conquista, fundando el convento de Aguas Vivas. Tras ello expanden a otras zonas como Alcoy. La fecha de fundación del Convento de San Agustín en Alcoy no está muy clara, pero se estima que ocurrió en torno al primer tercio del S.XIV, bajo expreso deseo regio de Jaime I.

En un primer momento gozaron del patronato de los señores de Alcoy, los Lauira, que les otorgaron una renta anual de 200 libras. Tras la muerte de Nicolás de Janvila, viudo de Margarita Lauria, el convento pasó a manos de la Corona. En estos tiempos fueron el único centro conventual de la comarca, hasta mediados del S. XVI, en que encontraron competidores en la Orden de los Franciscanos, que se introdujo en Alcoy en 1566 a instancia de autoridades municipales, y en la rama femenina de la orden agustina.

No obstante, es también en el S.XVI cuando convento encuentra su época de máximo explendor a través de la figura de Mencia de Ávalas, principal valedora del convento. En 1591 propuso la creación de un colegio anexo al convento. En 1598 las otras del Colegio de Santa Mónica hubieron terminado.

El s.XVIII se caracterizó por el aumento de frailes en el convento hasta puntos insostenibles y por los conflictos surgidos con la orden franciscana que quería crear un nuevo asentamiento. En 1835 con la exclaustración el convento cierra sus puertas.