Unidad militar dependiente del depósito de la Guerra responsable de la cartografía colonial.

Desde el siglo XIX, la responsabilidad cartográfica militar y colonial había recaído en el Cuerpo de Estado Mayor del Ejército, del que se encargaba una de sus dependencias, el Depósito de Guerra, creada en 1810. Dentro de esta dependencia existían dos secciones: Sección de Historia y Estadística Militar del Depósito y Sección Topográfica y Militar del Depósito.

Entre 1881 y 1882, a causa de la ocupación francesa de Túnez y en plena carrera imperialista de África, el Depósito de Guerra creó una unidad cartográfica específica con la misión de recabar información territorial del Magreb que se denominó Comisión de Estado Mayor de Marruecos. Posteriormente, dicha unidad recibió el nombre de Comisión Topográfica de Marruecos (1910-1920), Comisión Geográfica de Marruecos (1920-1925) y, finalmente, Comisión Geográfica de Marruecos y Límites (1925-1935)".

Desde su creación, la Comisión trabajó ininterrumpidamente en el territorio marroquí, dejando innumerable material cartográfico. Ramón Jáudenes fue el primer jefe de la Comisión de Marruecos. Desde un principio se concibió la idea de levantar un mapa completo a escala 1:100.000. Este plan tan ambicioso, provocó que la Comisión de Estado Mayor en Marruecos se transformase en una unidad estable y especializada, cuya actividad se prolongó hasta el periodo del Protectorado de España en Marruecos.

La Comisión de Estado Mayor fue formalmente reorganizada en octubre de 1909, recibiendo el nombre de Comisión Topográfica de Marruecos. Desde el establecimiento del Protectorado de España en Marruecos la Comisión se centró en la zona oriental del protectorado, convirtiéndose en cartografía de campaña, más urgente y comprometida, que suministraba cartografía operativa para atender los distintos conflictos militares que se prolongaron hasta 1927. En la zona occidental del protectorado, los trabajos topográficos se iniciaron tras la toma de Tetuán en 1913. Fueron dirigidos por secciones de la Comisión Geográfica de Marruecos radicadas respectivamente en Larache y Ceuta, que operaban con autonomía.

El desembarco de Alhucemas en 1925 supuso el inicio de la última gran fase del conflicto y la nueva preocupación por la demarcación de la frontera con el Protectorado de Francia. En noviembre de 1927 la Comisión Geográfica de Marruecos fue ampliada y reorganizada. Se abandonó el antiguo sistema de funcionamiento descentralizado con tres secciones situadas en Ceuta, Melilla y Larache en una sola jefatura radicada en Ceuta. En Melilla quedó únicamente destacada la sección de Límites. A efectos operativos, la Comisión de Marruecos se dividió en cuatro secciones: la ya citada de Límites, radicada en Melilla, una de Geodesia y dos de Taquimetría. En 1934 la Comisión de Marruecos levantó a escala 1:50.000 el territorio de Ifni y terminó el mapa a escala 1:50.000 del Protectorado de Marruecos.